Device Studio(简称:DS)作为鸿之微的材料设计与仿真软件,能够进行电子器件的结构搭建与仿真;能够进行晶体结构和纳米器件的建模;能够生成科研计算软件 Nanodcal、Nanoskim、MOMAP、RESCU、DS-PAW、BDF、STEMS、TOPS、PODS、VASP、LAMMPS、QUANTUM ESPRESSO、Gaussian的输入文件并进行存储和管理;可以根据用户需求,将输入文件传递给远程或本地的计算机进行计算,并控制计算流程;可以将计算结果进行可视化显示和分析。
上一期的教程给大家介绍了Device Studio亮点功能7.1-7.3的内容,本期继续介绍Device Studio亮点功能7.4-7.6的内容。
7.4. LAMMPS运动轨迹的显示
Device Studio具有显示 LAMMPS运动轨迹 的功能,LAMMPS运动轨迹文件的后缀名为 .dump 。以显示LAMMPS的运动轨迹文件 evolution.dump 为例,在Device Studio的图形界面中, 点击 Simulator → Lammps → Analysis Plot, 弹出导入LAMMPS运动轨迹文件的界面如图7.4-1所示,按照图7.4-1中的红色框选部分指示一步步操作, 点击 打开 按钮则弹出 LAMMPS运动轨迹 在Device Studio中的显示界面如图7.4-2所示,用户可根据需 要修改原子的颜色、原子的半径、播放的起始帧数和播放的结束帧数,点击 播放 按钮则开始显示LAMMPS的运动轨迹文 件 evolution.dump 。
图7.4-1: 导入 LAMMPS运动轨迹 文件的Device Studio界面
图7.4-2: LAMMPS运动轨迹 在Device Studio中的显示界面
7.5. 晶体结构的空间群信息识别
Device Studio具有识别晶体结构空间群信息和对称性信息的功能。例如在如图7.5-1所示的Device Studio的图形界面中,对于GaSe晶体结构,点击界面中的 Build → Symmetry 则弹出Symmetry界面如图7.5-2(a)所示,在图7.5-2(a)中可查看到GaSe晶体结构的空间群信息,点击 Symmetry界面中的 Operators 按钮,则如图7.5-2(b)所示可查看到GaSe晶体结构的对称性信息。
7.6. 拆分分子结构
Device Studio具有拆分分子结构功能,即将晶体结构拆分成一个个的分子结构。例如在如图7.6-1所示的Device Studio的图形界面中,对于C5H17AlN2O8P2晶体结构, 点击界面中的 Build → Decomposition 则将C5H17AlN2O8P2晶体结构拆分成6个分子结构,分别如图7.6-2(a)、7.6-2(b)、7.6-2(c)、 7.6-2(d)、7.6-2(e)、7.6-2(f)所示。
图7.6-1: 显示C5H17AlN2O8P2晶体结构的Device Studio界面
编辑:黄飞
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