病原菌的检测对于预防和治疗感染以及保障食品安全至关重要。目前的金标准检测技术,例如培养基检测和聚合酶链反应(PCR),不仅耗时,并且还需要集中在实验室进行。因此,人们致力于开发快速、廉价、便携且不需要专门培训的即时检测(POC)装置。基于纸张的分析装置恰好满足上述标准,特别适合在资源匮乏的环境中部署。
据麦姆斯咨询报道,近日,新南威尔士大学(The University of New South Wales,UNS)化学工程学院和澳大利亚纳米医学中心(Australian Centre for Nanomedicine,ACN)的研究人员在Nature Reviews Bioengineering期刊上发表了一篇题为“Paper-based sensors for bacteria detection”的综述文章,他们讨论了纸基细菌检测平台,不包括如病毒、寄生虫和真菌等其它微生物病原体。
重要的是,目前,只有满足(或接近满足)以下标准的健康诊断、食品质量控制和环境监测领域的研究被包含在内:传感器可以评估未经处理或未加工的样品,在资源匮乏的环境中满足可现场部署即时检测的REASSURED标准,并在相关实际范围内达到检测限(LOD)。对于后一个标准,重点将放在实现小于10²菌落形成单位(CFU) /ml的低检测限。同时,研究人员总结了纸基细菌检测平台面临的主要挑战。
注:REASSURED是Real-time connectivity, Ease of specimen collection, Affordable, Sensitive, Specific, User-friendly, Rapid/Robust, Equipment-free and Deliverable首字母缩写。
纸基传感技术发展时间线
纸基传感平台
纸基传感器的一个重要特点是,其可以通过毛细管流动自发地输送液体,因此不需要泵。此外,纸基传感器易于调节纸张孔径,以改变流速,并且纸张具有高的表面积与体积比,可使试剂固定和储存。最受欢迎的纸基传感平台是基于比色法的横向流动分析(LFA)。通常,横向流动分析由样品垫、共轭垫、检测垫和吸收垫等组成。
商用纸基传感器
针对标准的夹心免疫测定,首先需将样品引入样品垫以启动吸收过程。然后样品移向共轭垫,与标记的检测生物受体(通常是纳米粒子偶连的抗体)相互作用。在进一步迁移后,样品到达检测垫,检测垫包含一条测试线(捕获的生物受体与标记的分析物结合),以及一条对照线。最后,吸收垫吸收多余的样品,并规定测试所需的样品体积。纸基微流控分析装置遵循类似的机制,并受益于简单的设计、低廉的成本和5~30分钟的快速响应时间,具体取决于样品特性和应用场景。相比之下,尽管敏感性相当,基于电化学的技术研究却有所下降,可能由于其成本较高。
研究人员注意到,不同的应用需要不同的采样方法(破坏性或非破坏性)、质量保证和行业标准。例如,在固态食物样品中,病原体不像在液态样品中分布的那样均匀。本文中,研究人员将严格满足使用未加工样品、即时检测适用性和证明相关检测限标准的研究,根据样品的固体、液体和气体状态对其进行分组。该应用将从临床诊断到食品和环境中的病原体检测。
纸基传感器的操作过程
固态样品
用于固态样品(如牛肉、海鲜、面包和生菜)中细菌检测的纸基传感平台大多是基于比色的横向流动分析。这些传感器对用户很友好,适用于资源匮乏环境中的即时检测应用。研究人员基于横向流动分析结合扩增技术设计了几种平台,例如用于细菌检测的聚合酶链反应、表面增强拉曼光谱(SERS)或免疫磁性分离(IMS)等平台。他们还开发了使用环介导等温扩增(LAMP)或纸基酶联免疫吸附试验(ELISA)的其它方法。然而,此类方法需要加热,并且需集中在实验室处理,同时需要多个处理步骤,尽管该类系统更加复杂,但其灵敏度并不比简单的替代方案低多少(10²~10⁴菌落形成单位/ml)。
虽然CRISPR-Cas纸基细菌检测分析受益于固态样品的低检测限(1~10²菌落形成单位/ml),但它们需要重组酶聚合酶扩增(RPA)或重组酶辅助扩增(RAA)方法。这些步骤需在37°C~42°C间进行,与环介导等温扩增的60°C相比,更接近室温,然而,仍需要电源。此外,扩增组分(如Cas蛋白和引物)需要储存在远低于冰点的温度(零下20 °C)下,这意味着基于环介导等温扩增和基于CRISPR的方法在其当前状态下,并不符合所有的REASURED标准。
液态样品
与固态样品类似,针对液态样品(如血清、牛奶、水、果汁和婴儿配方奶粉溶液)中的细菌,研究人员主要使用基于横向流动分析的比色法检测,因其简单易行。其中大多数分析依赖于金纳米颗粒作为信号探针,但它们受到高检测限的限制(大于10³菌落形成单位/ml ),或需要样品预处理的限制。为了提高其性能,基于横向流动的分析已与磁性纳米颗粒等扩增方法相结合,以实现目标分析物(例如显色物质和酶)预浓缩,或实施聚合酶链反应、环介导等温扩增以及基于CRISPR-Cas的方法。然而,这些方法都受到以下一个或多个因素限制,例如高温、长响应时间、低灵敏度、大量样品制备和扩增步骤等。
气态样品
在空气悬浮液中也可以发现细菌,将其称为生物气溶胶。由于样品的性质,分析通常包括两个主要步骤:收集和检测。收集可通过沉淀、过滤、离心、冲击、撞击或微流控芯片实现。例如,带有细菌的空气样品可以通过纸基装置上的多孔采样垫。然后在取样垫上使用干燥的裂解缓冲液裂解收集到的细菌,释放DNA分子,然后通过水介导的侧向流将其输送至结合垫。这种测定的一个限制是,需要使用实时定量聚合酶链反应分析得到的等分试样。
总而言之,纸基分析平台的简单性和低成本引发了大量关于细菌检测的研究。与电化学、荧光或化学发光方法相比,大部分此类装置使用比色法作为分析技术。这种基于纸张的诊断工具在即时检测应用方面具有巨大潜力,但为了满足REASSURED标准,仍有几个关键挑战需要解决。特别是,考虑到特定的细菌和应用,需要改进检测限。选择性可以通过对样品中经常存在的目标化合物的干扰实验来解决,例如,对于临床诊断,应使用微生物群落背景和血清蛋白作为对照。在食品样品中,氨基酸、蛋白质和脂肪酸会干扰测定,而在农业样品中,土壤和植物蛋白质会影响测定。
此外,大多数研究通常评估其平台对其它致病菌的选择性。评估属或菌株水平的选择性以减少假阳性结果也很重要。细菌对环境或物理压力的反应会导致其表型状态或代谢活性的变化。因此,未来的研究,特别是那些依赖代谢释放的副产物(如挥发性有机化合物(VOC)和抗微生物菌株)的研究,必须定期校准,以明确这些变化,避免检测错误。此外,为了确保测量的准确性,需要考虑蛋白质水平、粘度和pH值。
审核编辑:刘清
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