SBC ToolBox单细胞分析模块上新组件了

 

Arrow 展示组件

给您的UMAP & t-SNE 图加箭头坐标，让你的UMAP展示添加几分灵动，不再那么的枯燥无味。

自由定义类群颜色进行展示；是不是看到选颜色已经手足无措了，不用担心， SBCToolBox默认采用ggsci的配色，不去自定义颜色您的图形展示也一样可以清新脱俗；如果觉得还不满意，您可以跳转到https://www4.shbiochip.com/V2023/ColSp/ 网站去筛选您中意的颜色搭配，让您的可视化结果更上一层楼。

上新第二弹

差异计算模块组件

单个类群与其他类群的差异比较分析添加TopN基因筛选，可控范围内自由调节，筛选出每个类群的高表达marker基因，助您快速注释细胞类型。

添加指定类群间的差异筛选，您有多个样本的数据，想看下同一类群中不同样本间的差异，用这个就够了，可以帮您快速筛选出指定类群间的差异marker。

上新第三弹

筛选目标类群组件

根据信息预览的meta.data信息，筛选出目的Cluster或者目标样本，将目的细胞提取出来保存，如果是多个样本，也可以根据样本情况对数据进行拆分并保存。

上新第四弹

FeaturePlot 按列调整

根据基因展示数量情况，调整基因展示的列数，以达到FeaturePlot多行展示的目的。

上新第五弹

meta信息添加

您已经对每个Cluster做好了细胞类型注释，您可以先使用SBCToolBox的表格处理模块对您的meta数据进行合并注释得到每个细胞barcode和细胞类型的注释表格，如下图：

链接：

https://www4.shbiochip.com/V2023/Sht/ShtC/

提交到注释信息添加组件上，就可以轻松添加注释信息。您的项目有多个样本，对其进行分组，也可以通过上述方式进行注释，注释预览如下，注释完成，您可以下载rds文件进行下一步分析。

完成细胞注释后的展示：

这里需要重新提交注释并保存的rds文件。修改默认展示标签，即可完成分析，下图展示了注释完结果后的UMAP图及新的细胞类型与样本间的比例情况。