一文解析X射线粉末衍射晶体结构

描述

前言

X射线衍射分析只是给出了晶体的结构,根据晶体结构与物相的对应关系,最终找到匹配的物相,其实相似的晶体结构可能与很多成分完全不同的物相对应,如果设定一定的误差,一组衍射峰可能与多种物相完全匹配,仅从衍射峰位置角度分析是无法找到准确的物相。因此,X射线衍射方法是分析物相的,并不准确,它是求解晶体结构的。本文介绍晶体结构晶胞参数的求解过程。

假设用一种纯晶态粉末物相做X射线衍射分析,实验获得的仅是一组2theta角,利用布拉格方程可以获得一组晶面距d值。求解晶体结构必需应用很多的隐含条件。晶面距与晶胞参数及晶面指数是有关联的,这种关联方程是利用纯数学方法,其中主要是几何数学与矢量数学方法,读者就可以建立这些方程(仅是高中数学知识就可以了),当然可以直接引用这些方程;能产生衍射的晶面指数是有规律的,这些规律即可以自己推导出来,计算相关结构因子,结构因子等于0的晶面指数不能产生衍射,同时可以直接参考前辈总结的能产生衍射的晶面指数的规律,假定某一晶系,某一点阵后,具体的晶面指数排列顺序就是己知的,晶面间距d值也是己知的,解晶面距与晶胞参数、晶面指数的方程,就可以求解晶胞参数。这是利用X射线衍射方法求解晶体结构的思维逻辑。

晶面距与晶胞参数、晶面指数的方程

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晶面指数的规律

表1  四种基本类型点阵的反射和消光规律

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表2 在立方晶系中密勒指数与密勒指数的平方和(*表示密勒指数的平方和)

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表3石英、石墨、锌、氧化锌和镁的密勒指数

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读者可搜集更多的晶面指数排列规律表格。

陈亮维根据结构因子的计算规律,提炼成下面的公式:

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其中hkl是晶面指数,xyz是某一原子的坐标,i是原子序数,n是自然数。满足上述条件的晶面指数是能产生衍射的。

解晶体结构实例

在实际解晶体结构时就采用尝试方法,从高对称的晶系出发一个一个试错计算,即假设是某一晶系和某一点阵,用该晶系和点阵的前1个(对于立方晶系或菱方晶系),前2个(四方或六方晶系),前3个(正交晶系,单斜晶系)晶面指数、晶面距代入对应的晶面距与晶胞参数、晶面指数方程,求解晶胞参数。三斜晶系非常小见,要解6个方程。把晶面距与晶胞参数、晶面指数方程代入Excel文档,可以减小重复计算工作量。

当前有很多解粉末衍射晶体结构的软件,推荐中科院董成研究员设计编程的 PowderX软件,是免费使用的软件。

希望读者了解粉末衍射方法解晶体结构的科学原理。

X射线

 

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从前面2个实例的衍射数据,前面的衍射峰对应的晶面指数是简单的低指数,因此解析晶胞参数的数学计算工作量很小,解晶胞参数是比较容易的。陈亮维就是用这种尝试方法手工解析出一些晶体的结构参数,其中包括了屠呦呦合成的青蒿素和蒿甲醚的晶体结构,CuSi6.69中间合金的晶体结构。读者可以在ICDD的数据库里搜到。

 

参考文献:

【1】陈亮维,易健宏,虞澜,史庆南编著,材料晶体衍射结构表征【M】,北京化工出版社,2024.6

 

 

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