通过 Prime BSI Express 将数据传输速度提升 700%

　　关键成果

　　存储需求减少 87%

　　数据集传输速度提升 700%(从 4 小时缩短至 30 分钟)

　　全球团队间的无缝协作

　　挑战

　　维斯中心(瑞士日内瓦)服务于150多家用户和机构，专注于大型组织3D扫描、全脑成像、3D转录组学、神经回路神经解剖学等领域。维斯中心内的先进光片成像中心(ALICe)是欧洲领先的神经成像设施之一，配备先进的显微镜系统和科学相机，如Teledyne Photometrics的Prime BSI Express，研究人员可捕获高度详细的数据集，产生数TB的数据。通过1 Gbit/s的连接传输单个2 TB的数据集需要超过四个小时。有限的存储空间、不断上涨的云成本以及碎片化的访问方式，减缓了全球范围内的协作并推迟了实验进度。

　　解决方案

　　dotphoton(瑞士楚格)专注于先进的图像数据压缩解决方案，能够在显著减小文件大小的同时保留原始图像质量，非常适合ALICe等高内容成像应用。dotphoton的主要图像数据管理解决方案是Jetraw，这是一款介于显微镜和存储系统之间的软件，能够简化从采集到存储的整个工作流程。Jetraw可加速数据传输，并将存储需求平均降低七倍，同时以合规且安全的方式保留原始图像质量。

　　随着Jetraw集成到Wyss中心的成像基础设施中，来自先进采集系统和科学相机(如Teledyne Photometrics的Prime BSI Express)的所有数据在保持最高图像质量的同时，体积平均减少了87%，传输速度提升了700%。现在，2 TB的数据集仅需30分钟即可完成传输，实现了无需改变工作流程的无缝全球协作，并加速了研究进程。

　　传输大型数据集曾是我们工作流程中的主要瓶颈。Jetraw 结合 Prime BSI Express 相机，使我们能够通过促进大型数据集的快速共享，显著提升我们工作的成果，并支持全球范围内的众多合作。——劳拉·巴蒂博士，ALICe 设施经理，Wyss 中心

　　Wyss中心的高通量成像系统每年产生超过100 TB的数据。其中，Clearscope光片显微镜产生的数据集尤为庞大，单次实验往往超过2 TB。通过1 Gbit/s的连接传输此类数据集可能需要超过四个小时，而存储限制、云端成本和碎片化的访问方式则拖慢了协作速度并延误了实验进度。

　　Jetraw 解决方案已在所有光片系统中实施，以支持大规模成像数据集的高效处理和共享。在 ClearScope 上，该系统针对大型复杂样本的高分辨率成像进行了优化，例如人类透明化组织的整器官和多区域采集，Jetraw 保留了 Teledyne Photometrics Prime BSI Express 相机无损的图像质量，用于后续的可视化和分析。

　　Wyss中心实现了8:1的压缩比，将存储需求降低了87%，并将数据集传输时间从4小时缩短至仅30分钟。研究人员现在的数据共享速度提升了7倍，这使得全球团队能够更有效地协作，同时降低了基础设施成本。

　　在Jetraw出现之前，跨团队和系统的数据传输缓慢、昂贵且不可靠。如今，数据集在本地存储系统、NAS和云环境之间能够顺畅传输，压缩文件可直接在分析工具中访问。数据处理能力的提升使Wyss Center能够扩大其设施的开放程度，加强国际合作，并支持处于研究前沿的新型大规模神经科学项目。

　　展望未来，在ClearScope等系统上实现高效的数据压缩与管理，对于大规模类器官成像等高通量应用至关重要。通过降低存储需求并加速数据传输，Jetraw实现了可扩展的工作流程，并解锁了以往无法实现的筛选策略。——劳拉·巴蒂博士，ALICe 设施经理，Wyss 中心

　　Prime BSI Express

　　Prime BSI Express 是一款强大且灵活的光片显微镜解决方案，是 Wyss Center ClearScope 成像系统首选的 sCMOS 相机。得益于小像素和宽广的视场，它能够在大型样本上实现亚细胞级分辨率。此外，该相机同时具备高动态范围的 16 位模式和低噪声的 12 位 CMS 模式，用户可根据成像需求选择模式，从而实现高动态范围下的高灵敏度成像。

　　Prime BSI Express 还具备可编程扫描模式，可控制相机读出的方向和速度。这非常适合光片扫描技术，因为光束扫过样本的过程可以与相机读出同步。

　　总的来说，Prime BSI Express 是光片显微镜的成熟解决方案，结合 Jetraw，可以获取海量数据并轻松传输进行分析。