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基于Intel MIC平台大规模耗散粒子动力学模拟的设计与优化
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2017-11-17
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耗散粒子动力学（DPD）模拟是一种重要的研究流体动力学特性的计算模拟方法，基于Intel MIC平台设计实现了面向大规模耗散粒子动力学模拟，充分结合了DPD模拟本身的特性和MIC平台的特征。对DPD模拟中的近邻列表构建和短程作用力关键代码实现了向量化优化，在CPU和MIC协处理器之间采用任务计算负载平衡机制，支持MPI进程内线程数量负载平衡控制。分别在原型程序上和LAMMPS集成中做了性能对比分析，实验结果显示了引入相关优化技术的有效性，为进一步研究面向MIC众核平台的分子动力学相关工作奠定了基础。
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