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RNA-Seq差异异构体比例检测方法
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2017-11-23
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近年来，RNAseq技术被广泛应用于差异表达基因和异构体的检测，但目前大多数方法都是识别单个异构体的差异表达，无法同时检测同一个基因中所包含异构体表达比例的差异，因此提出一个差异异构体比例检测方法。该方法基于先前设计的sl。DASeq模型，运用该模型中隐含变量的概率分布，采用KI。散度进行差异异构体比例的分析。首先使用最新的SEQC数据集评估sLDASeq模型表达水平的性能，结果表明该方法能准确地估计基因中异构体的比例。接着通过模拟数据集进行差异异构体比例的检测，与其他方法相比，实验结果表明该方法在差异异构体比例检测方面具有较高的准确性。
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